U Sektoru za riznicu obavljaju se sljedeći poslovi:

• upravljanje novčanim sredstvima,
• upravljanje računima koji su u sustavu Jedinstvenog računa riznice,
• planiranje novčanih tokova,
• upravljanje plaćanjima,
• centralizirani obračun plaća,
• zaduživanje i upravljanje dugom,
• upravljanje računovodstvom u javnom sektoru,
• financijsko izvješćivanje o izvršavanju proračuna.

U Sektoru za riznicu uspostavljene su dvije unutarnje organizacijske jedinice: Odsjek za javne prihode, plaćanja i zaduživanje i Odsjek za računovodstvo i izvještavanje.

U Odsjeku za  javne prihode, plaćanja i zaduživanje obavljaju se sljedeći poslovi:

• evidencija javnih prihoda,
• raspodjela javnih prihoda,
• upravljanje novčanim sredstvima i nadziranje gotovine,
• plaćanje obveza,
• vršenje povrata više ili pogrešno uplaćenih javnih prihoda,
• praćenje i otplata duga i izdavanje jamstava,
• upravljanje neangažiranim novčanim sredstvima,
• izrada izvješća i informacija za potrebe Ministarstva,
• drugi poslovi sukladno planovima i programima rada.

U Odsjeku za računovodstvo i izvještavanje obavljaju se sljedeći poslovi:

• prikupljanje knjigovodstvenih podataka od proračunskih korisnika,
• kontrola i unos knjigovodstvenih podataka u pomoćne i Glavnu knjigu riznice,
• uspostavljanje i vođenje sistema Glavne knjige riznice,
• centralizirani obračun plaća i naknada,
• vođenje računovodstvenih evidencija u skladu s međunarodnim računovodstvenim standardima,
• praćenje i izrada izvješća o izvršenju proračuna,
• izrada financijskih izvješća u skladu s Pravilnikom o financijskom izvještavanju i godišnjem obračunu proračuna u Federaciji Bosne i Hercegovine,
• drugi poslovi sukladno planovima i programima rada.